简介:第二集中,尼奥没有能从内部摧毁“母体”,他的身体在真实世界的飞船上陷于昏迷,思想却被困在介于“母体”和真实世界的中央地带,这个地方由“火车人”控制墨菲斯和崔妮蒂等人知道了尼奥的情况,在守护天使的带领下,找到了“火车人”的控制者梅罗纹奇,经过一番激斗,将尼奥救了出来。此时,电子乌贼部队对锡安倡议了猛烈的攻击,人类组织所有机甲战士展开顽强的抵抗,形势危在旦夕;尼奥和崔妮蒂驾驶了一艘飞船降服重重困难,达到机器城市,尼奥终于见到了机器世界的统治者“机器大帝”,两边谈判并达成了和谈:尼奥除掉不受“母体”控制的史密斯,以换取锡安的和平。在“母体”中,尼奥和史密斯展开了关系人类生死存亡的最后决战。